Đồ án tốt nghiệp - Mô phỏng tương tác giữa các dẫn xuất Chalconoid và 3 ĐVHMTT ( VA ( BDPT

m7

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP. HỒ CHÍ MINH


KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC

MÔ PHỎNG TƯƠNG TÁC GIỮA
CÁC DẪN XUẤT CHALCONOID VÀ
3-HYDROXYFLAVONE ĐỐI VỚI HAI
MỤC TIÊU TUBULIN (4O2B) VÀ
ACLY (6O0H) BẰNG DOCKING
PHÂN TỬ
SVTH: Võ Tuấn Kiệt
MSSV: 20128074
GVHD: PGS.TS. Hoàng Minh Hảo

Tp. Hồ Chí Minh, tháng 08 năm 2024

m7

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP. HỒ CHÍ MINH


KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC

MÔ PHỎNG TƯƠNG TÁC GIỮA
CÁC DẪN XUẤT CHALCONOID VÀ
3-HYDROXYFLAVONE ĐỐI VỚI HAI
MỤC TIÊU TUBULIN (4O2B) VÀ
ACLY (6O0H) BẰNG DOCKING
PHÂN TỬ
SVTH: Võ Tuấn Kiệt
MSSV: 20128074
GVHD: PGS.TS. Hoàng Minh Hảo

Tp. Hồ Chí Minh, tháng 08 năm 2024

TRƯỜNG ĐH SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP.HCM
KHOA CÔNG NGHỆ HÓA HỌC-THỰC PHẨM
BỘ MÔN CN HÓA HỌC

CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM
Độc lập – Tự do – Hạnh phúc

-

-

PHIẾU TRẢ LỜI GÓP Ý NỘI DUNG KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
I. Thông tin chung
- Họ và tên sinh viên: Võ Tuấn Kiệt

Lớp: 20128H

- Tên đề tài: Mô phỏng tương tác giữa các dẫn xuất chalconoid và 3-hydroxyflavone
đối với hai mục tiêu Tubulin (4O2B) và ACLY (6O0H) bằng docking phân tử
- Mã số khóa luận: ..................................................................................................
- Họ và tên người hướng dẫn chính: PGS.TS. Hoàng Minh Hảo
II. Nội dung trả lời
STT
1

2

Nội dung góp ý
Một vài lỗi format và chính tả

Một số từ chuyên ngành chưa chính
xác

3

Cập nhật danh mục từ viết tắt

4

Bổ sung tài liệu tham khảo

Nội dung trả lời
Đã chỉnh sửa format và chính tả trong
toàn bộ khóa luận
Đã chỉnh sửa cụm từ dị vòng tubulin
thành tubulin heterodimer trong toàn
bộ khóa luận
Đã bổ sung danh mục từ viết tắt cho
GTP, GDP, NMR, MS
Đã bổ sung tài liệu tham khảo ở trang
20, 21, 23 và 38

Tp. Hồ Chí Minh, ngày

tháng

năm 2024

GV PHẢN BIỆN

SINH VIÊN THỰC HIỆN

(Ký và ghi rõ họ tên)

(Ký và ghi rõ họ tên)

Võ Tuấn Kiệt

TÓM TẮT
Đặt vấn đề: Protein tubulin và enzyme ATP-citrate lyase hiện được xem là mục tiêu tiềm
năng và hiệu quả để phát triển thuốc kháng ung thư trong đó có ung thư gan. Tubulin là
thành phần chính của các microtubule – vi ống đóng vai trò hình thành nên các trục phân
bào trong quá trình nguyên phân cũng như là hình thái tế bào. ATP-citrate lyase đóng
vai trò quan trọng trong quá trình chuyển hóa glucose và tân tạo lipid trong cơ thể, cung
cấp năng lượng
...

...
342.
Thr353, Phe354,
Arg378, Tyr307,
Ser308, Phe347,
Ala310, Val350,
Ile344, Thr348,
Asn349.
Ile357, Ala280,
Phe354, Ser343,
Ile344, Gly342,
Phe347, Arg378,
Arg379, Val377,
Ile340.

8

KP03

-11,9478

Gly342

9

NT02

-10,9312

Thr353

10

NT03

-11,5056

Thr353

11

NT01

-12,8082

Asn346,
Asn349

12

TH02

-10,7402

Gly380

13

VK02

-10,8631

Thr353

14

TX02

-10,7699

-

15

KC01

-11,9076

Asn349

PL-16

Gly341, Ile340,
Ser343, Ile344,
Phe347, Phe354,
Ile357, Thr353,
Val377, Arg379,
Gly380, Arg378.
Phe347, Asn346,
Asn349, Thr348,
Ala310, Val350,
Ile344, Tyr307,
Arg378, Val377,
Phe354, Ile340.
Tyr307, Ala280,
Gly380, Gly341,
Arg379, Gly342,
Arg378, Phe347,
Ala310, Asn346,
Val350, Thr348,
Asn349, Ile344.
Ser308, Phe347,
Gly309, Thr353,
Val350, Ala310,
Phe354, Pro382,
Arg379, Thr348,
Tyr307, Ile344,
Gly380.
Val279, Ile340,
Ala280, Met278,
Gly341, Ser343,
Gly342, Phe354,
Pro382, Val350,
Tyr384, Arg379,
Phe347.
Val279, Met278,
Tyr319, Ile357,
Tyr307, Phe347,
Phe354, Arg378,
Gly380, Arg379,
Ala280.
Arg378, Ser343,
Gly341, Val377,
Ile340, Gly342,
Ile344, Gly380,
Phe347, Thr353,
Phe354, Ile357.
Phe354, Thr353,
Thr348, Ala310,
Asn346, Phe347,
Val350, Ile344,
Ser343, Arg378,
Gly342, Arg379,
Gly341, Gly380.

16

LH02

-11,5686

-

17

KP04

-11,0099

Thr353

18

KP05

-11,1792

Thr353

19

KP06

-11,5884

Thr353

20

NT06

-11,4828

Asn668

21

NT08

-11,8797

-

22

NT04

-10,6853

Ile344

PL-17

Arg379, Met278,
Ala280, Val279,
Ile357, Tyr319,
Thr316, Tyr307,
Thr353, Phe354,
Phe347, Arg378,
Gly380.
Ile340, Phe354,
Arg379, Val377,
Arg378, Met278,
Ala280, Val279,
Tyr319, Thr316,
Ile357, Tyr307.
Thr316, Tyr307,
Arg378, Phe354,
Val377, Arg379,
Ile340, Ile357,
Met278, Ala280,
Val279, Tyr319.
Thr316, Ile357,
Tyr307, Tyr319,
Val279, Ala280,
Met278, Arg378,
Gly380, Val377,
Arg379, Phe354,
Ile340.
Phe354, Arg379,
Ile357, Ile340,
Val377, Gly341,
Gly380, Arg378,
Gly342, Ala280,
Ser343, Phe347,
Ile344.
Arg378, Arg379,
Val377, Phe354,
Ile340, Thr353,
Ile357, Thr316,
Tyr307, Tyr319,
Met278, Ala280,
Val279.
Phe347, Asn668,
Ser343, Gly342,
Ala380, Phe354,
Ile357, Thr353,
Met391, Val377,
Ile340, Gly380.

PHỤ LỤC 5. Mô phỏng tương tác của các hợp chất ức chế với protein ATP-citratre
lyase (6O0H).

STT

Ligand

Mô hình tương tác

1

2

3

PL-18

4

5

6

KP01

7

KP02

PL-19

8

KP03

9

NT02

10

NT03

11

NT01

PL-20

12

TH02

13

VK02

14

TX02

15

KC01

PL-21

16

LH02

17

KP04

18

KP05

19

KP06

PL-22

20

NT06

21

NT08

22

NT04

PL-23